تاسیسات مربوط به سیستم تصفیه فاضلاب صنعتی و بهداشتی و جمع آوری و بازیافت آبهای سطحی در پایین ترین تراز ارتفاعی واقع در شمال شرقی مجتمع ساخته شده اند.
این بخشها شامل : واحد تصفیه فاضلاب بهداشتی ، تصفیه فاضلاب صنعتی و بازیافت آب باران می باشند.
از فاضلاب بهداشتی پس از تصفیه و رسیدن کیفیت آن به استانداردهای مجاز ، به منظور آبیاری فضای سبز استفاده می گردد. فاضلاب صنعتی و آب باران جمع شده پس از تصفیه و پس از رسیدن آن به استانداردهای تعریف شده به عنوان آب جبرانی در فرایند تولید محصول استفاده می گردد. بجز بخشی از مازاد آب باران جمع شده (درصورت بارشهای بسیار شدید) هیچ فاضلابی اعم از بهداشتی و صنعتی از مجتمع خارج نخواهد شد و تمام فاضلاب تولید شده مجدداً مورد استفاده قرار می گیرد.